VR 공간 LINK VRAINS에 어딘가 존재한다는 Al들의 세계 '사이버스'를 멸망시키려 하는 수수께끼의 해커집단 '하노이의 기사'가 나타나고, 그 하노이의 기사를 막는 주인공이 과거에 일어난 어떤 사건의 진실을 알아내려 하며 벌어지는 이야기