도쿄 서부에 위치한 거대한 ′학원도시′. 총인구가 230만 명이 넘고 그중 약 8할을 학생이 차지하는 이 도시에서는 초능력 개발을 위한 특수한 커리큘럼이 시행되어 학생들의 능력은 레벨 0에서 레벨 5까지의 6단계로 평가되고 있었다. 그런 학원도시에서 능력자들의 정점에 군림하는 최강의 능력자 액셀러레이터. 7명밖에 없는 레벨 5 중에서도 특별히 뛰어난 능력을 자랑하는 제1위는 그 힘 때문에 살벌한 일상을 보내고 있었다. 반복되는 상식을 벗어난 ′실험′과 절대적인 힘을 원했던 끝에 경험한 패배. 그 너머에서 그를 기다리고 있던 것은 어떤 소녀 라스트 오더와의 만남에 의해 운명이 크게 바뀌게 된다. 최강이자 최흉인 ′악′ 액셀러레이터가 학원도시의 ′어둠′을 쓸어버린다!!