가마돈이 닌자고 시티를 점령하자, 로이드, 니야, 대럿은 냉동창고로 숨어들어간다. 힘을 잃고 낙담하던 로이드는 드래곤 전함의 잔해를 발견하고 다른 닌자들이 살아 있다는 사실에 기뻐하며 과거로부터 돌아온 원소 마스터들의 도움을 받게 된다. 한편, 쟌, 제이, 카이, 콜은 어린아이가 된 마스터 우와 함께 도깨비와 드래곤의 세상에 떨어지게 된다. 그리고 쟌, 제이, 카이는 그곳에 살고 있는 드래곤 헌터들에게 붙잡히게 되는데…