크리스마스를 준비하던 뽀로로는 장난으로 파티를 망치고, 친구들의 핀잔에 선물을 못 받을까 걱정하던 중 산타의 구조 요청 편지를 받는다. 산타는 디저트 왕국으로 토핑통을 전달하던 중 마법에 걸려 인형이 되었고, 뽀로로는 산타를 돕기로 결심한다. 하지만 디저트 왕국은 초콜레오 박사의 공격으로 위기에 처해 있었다. 그는 자신의 초콜릿이 거절당하자 분노해 여왕과 주민들을 초콜릿으로 만들고 감금한 것이다. 뽀로로는 여정 중 꼬마 마녀 버니와 갈등을 빚고, 포비와 패티가 인형으로 변하면서 친구들과 흩어지게 된다. 디저트 왕국에 도착한 뽀로로와 크롱은 위기의 전말을 듣고 초콜레오를 막기로 하지만, 쿠키 대장마저 당하고 만다. 이후 버니가 단지 친구를 원하는 외로운 아이였다는 것을 알게 된 뽀로로는 그녀와 화해하고 함께 싸우기로 결심한다. 과연 이들은 초콜레오 박사를 물리치고 크리스마스를 구할 수 있을까?