우주세기 0123년, 코스모 바빌로니아 건국을 목표로 하는 크로스본 뱅가드가 신흥 콜로니 프론티어 IV를 기습 공격한다. 시북은 동료들과 함께 프론티어 I로 도망치지만, 뜻하지 않게 어머니가 개발에 관여한 신형 MS 건담 F91에 탑승하게 되고 전투에 휘말리게 된다. 깨어나라, 우주! 건담 신시대 제1장!