부모님의 잦은 다툼과 친구들의 따돌림으로 괴로운 여고생 ′마코′. 마음 기댈 곳 하나 없이 외로운 그녀에게 유일한 즐거움은 멋진 닌자 소녀들이 나오는 그림책을 읽는 것이다. 그러던 어느 날, 점점 심해지는 따돌림으로 지친 ‘마코’ 앞에 그림책에 등장했던 닌자 소녀 ′유우′와 ′히로′가 나타난다. 그렇게 두 사람은 마코를 다른 차원의 시공간으로 데려가는데... 평범한 여고생에서 No.1 최강 닌자 소녀로!